More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5078 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5078  Transketolase central region  100 
 
 
322 aa  640    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  48.94 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  48.94 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  47.35 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  47.35 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1944  Transketolase central region  49.22 
 
 
325 aa  275  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.37 
 
 
328 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  48.15 
 
 
324 aa  268  8e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  47.04 
 
 
324 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  48.32 
 
 
347 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  47.76 
 
 
335 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5071  Transketolase central region  48.77 
 
 
325 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.067721  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  47.8 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  46.67 
 
 
328 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  46.39 
 
 
330 aa  264  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.79 
 
 
449 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  46.86 
 
 
330 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  47.37 
 
 
332 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  47.98 
 
 
448 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16211  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.25 
 
 
327 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.220601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  47.28 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  43.77 
 
 
337 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  45.45 
 
 
341 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.43 
 
 
468 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.02 
 
 
469 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  46.18 
 
 
348 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  42.59 
 
 
324 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  48.38 
 
 
326 aa  258  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  43.79 
 
 
332 aa  258  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  42.55 
 
 
327 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  43.03 
 
 
328 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  42.55 
 
 
327 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.74 
 
 
344 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.74 
 
 
344 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.15 
 
 
331 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.74 
 
 
344 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.74 
 
 
344 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.74 
 
 
344 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  44.27 
 
 
327 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.74 
 
 
344 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  47.76 
 
 
332 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  44.44 
 
 
344 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.44 
 
 
344 aa  256  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  47.59 
 
 
342 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  42.86 
 
 
327 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  46.34 
 
 
344 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  43.48 
 
 
327 aa  256  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  42.55 
 
 
324 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  43.52 
 
 
327 aa  255  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.14 
 
 
344 aa  255  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  41.43 
 
 
326 aa  255  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.05 
 
 
465 aa  255  8e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.17 
 
 
456 aa  255  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  41.61 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  43.79 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.84 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  41.61 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  44.41 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  47.27 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.05 
 
 
465 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  41.67 
 
 
325 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  47.56 
 
 
348 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  41.93 
 
 
327 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.77 
 
 
467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  44.82 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  44.11 
 
 
340 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  40.63 
 
 
326 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  45.54 
 
 
331 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0869  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  42.22 
 
 
327 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.73 
 
 
459 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  44.27 
 
 
327 aa  251  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  41.18 
 
 
327 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  43.81 
 
 
340 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  42.22 
 
 
327 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  42.59 
 
 
325 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  43.34 
 
 
326 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  40.12 
 
 
325 aa  250  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09301  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  42.22 
 
 
327 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  42.55 
 
 
327 aa  249  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10131  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.59 
 
 
327 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  41.67 
 
 
327 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  48.9 
 
 
335 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  44.58 
 
 
327 aa  249  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.05 
 
 
474 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  43.54 
 
 
339 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  41.36 
 
 
328 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  41.36 
 
 
328 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.06 
 
 
483 aa  248  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.06 
 
 
461 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  41.72 
 
 
327 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07151  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  42.22 
 
 
327 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.132194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.41 
 
 
482 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  42.39 
 
 
329 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  43.69 
 
 
339 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  42.47 
 
 
337 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1280  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  42.54 
 
 
327 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  43.17 
 
 
343 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.69 
 
 
480 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.06 
 
 
448 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  46.06 
 
 
339 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>