More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1039 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  100 
 
 		 324 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  64.38 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  54.37 
 
 		 327 aa  332  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  52.68 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  52.22 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0347  transketolase, central region  50 
 
 		 334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  50.32 
 
 		 657 aa  305  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  45.31 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  46.98 
 
 		 322 aa  301  8.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  49.69 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  47.52 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.3 
 
 		 328 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  45.86 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  44.76 
 
 		 332 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  49.22 
 
 		 343 aa  294  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  46.56 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  46.56 
 
 		 327 aa  293  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  46.54 
 
 		 325 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  45.89 
 
 		 332 aa  291  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  45.96 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1610  transketolase, central region  47.66 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  45.78 
 
 		 346 aa  289  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  46.15 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.01 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  47.74 
 
 		 335 aa  287  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.01 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.01 
 
 		 344 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  46.01 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.01 
 
 		 344 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.01 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  47.04 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.73 
 
 		 461 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  46.73 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.88 
 
 		 448 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  46.54 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  45.71 
 
 		 344 aa  285  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  46.44 
 
 		 327 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  45.34 
 
 		 327 aa  285  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  49.68 
 
 		 675 aa  285  9e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.09 
 
 		 344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  46.35 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  47.99 
 
 		 325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.09 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  45.51 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  49.53 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  47.66 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  47.66 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  47.09 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  47.09 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  44.24 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  46.11 
 
 		 328 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.13 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  46.77 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  47.04 
 
 		 324 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  48.57 
 
 		 332 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  45.79 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  45.85 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  45.85 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  48.73 
 
 		 345 aa  278  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  45.85 
 
 		 340 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  48.46 
 
 		 338 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  46.11 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  47.32 
 
 		 327 aa  277  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3932  Transketolase central region  50.31 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  46.73 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  46.53 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  46.79 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  46.11 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  43.75 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  47.35 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  44.34 
 
 		 325 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  44.34 
 
 		 325 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  44.34 
 
 		 325 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  45.37 
 
 		 332 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46160  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  46.25 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  46.5 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  42.37 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  43.48 
 
 		 325 aa  272  4.0000000000000004e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  45.68 
 
 		 339 aa  272  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0535  pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta  45.03 
 
 		 327 aa  271  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  43.79 
 
 		 326 aa  271  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.45 
 
 		 465 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  46.91 
 
 		 334 aa  271  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.38 
 
 		 465 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.17 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.36 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3570  Transketolase central region  47.06 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0714201 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4646  Transketolase central region  47.06 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  42.37 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  47.83 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  46.46 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  46.43 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0763  transketolase, central region  44.48 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780624  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.15 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0509  transketolase, central region  44.76 
 
 		 326 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  44.58 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  46.71 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.82 
 
 		 456 aa  268  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.81 
 
 		 468 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.17 
 
 		 467 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>