More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0856 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  100 
 
 		 324 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  64.38 
 
 		 324 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  50.63 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  51.1 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  52.52 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  48.44 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.92 
 
 		 328 aa  298  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0347  transketolase, central region  49.52 
 
 		 334 aa  298  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  48.31 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  48.77 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  50.32 
 
 		 335 aa  295  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  48 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  50.93 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  47.37 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  46.13 
 
 		 327 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  46.13 
 
 		 327 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  48.44 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  43.48 
 
 		 332 aa  292  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  47.3 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  49.06 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  46.48 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  47.3 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  47.3 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  45.51 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  45.51 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0509  transketolase, central region  48.1 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  46.44 
 
 		 343 aa  285  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  47.35 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  47.31 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  46.63 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  46.23 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  45.79 
 
 		 327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  46.5 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  45.94 
 
 		 327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  47.04 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  47.62 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  47.23 
 
 		 657 aa  279  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  47.53 
 
 		 675 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  47.48 
 
 		 327 aa  279  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  44.89 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  49.69 
 
 		 356 aa  278  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  44.24 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0535  pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta  46.32 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  48.32 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  43.12 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  44.31 
 
 		 340 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  44.31 
 
 		 340 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  47.6 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  44.01 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  41.02 
 
 		 346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.88 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  45.06 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  49.23 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  44.58 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  46.08 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1409  transketolase, central region  46.82 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.88 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.58 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  43.44 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  47.69 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.88 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  45.94 
 
 		 332 aa  271  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.58 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.58 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.58 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  45.57 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.58 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  45.89 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.28 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.54 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3932  Transketolase central region  51.33 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  43.81 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  46.79 
 
 		 324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1217  Transketolase domain protein  42.99 
 
 		 330 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  46.79 
 
 		 324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3222  Transketolase central region  47.52 
 
 		 345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.56 
 
 		 448 aa  268  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  41.93 
 
 		 328 aa  268  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.48 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  47.59 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.9 
 
 		 332 aa  267  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  47.53 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  40.81 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  45.17 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  45.51 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.63 
 
 		 467 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.45 
 
 		 468 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10780  TPP-dependent dehydrogenase, E1 component beta subunit  47.11 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  48.14 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.27 
 
 		 466 aa  265  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3317  transketolase central region  49.69 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  42.95 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.08 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.33 
 
 		 467 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  46.39 
 
 		 330 aa  265  8.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  41.12 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  43.38 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  45.35 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.06 
 
 		 332 aa  263  2e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.48 
 
 		 460 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>