More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1750 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  100 
 
 		 348 aa  701    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  84.97 
 
 		 348 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  78.38 
 
 		 347 aa  544  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  75.38 
 
 		 341 aa  541  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  69.09 
 
 		 339 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  61.98 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  65.38 
 
 		 342 aa  424  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  64.65 
 
 		 348 aa  414  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  57.66 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  58.59 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  56.2 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  54.08 
 
 		 324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  51.38 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2771  Transketolase central region  53.51 
 
 		 339 aa  328  7e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  48.48 
 
 		 324 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  45.48 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  45.48 
 
 		 333 aa  305  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  48.19 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  47.66 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  46.31 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  45.16 
 
 		 339 aa  295  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  45.59 
 
 		 344 aa  295  7e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  47.45 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  47.45 
 
 		 327 aa  295  8e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  47.72 
 
 		 330 aa  295  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  50.61 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  49.26 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  45.92 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  45.48 
 
 		 657 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.48 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  45.48 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.48 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.48 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  48.1 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  45.19 
 
 		 344 aa  292  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  45.19 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  48.25 
 
 		 337 aa  292  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.19 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.19 
 
 		 344 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  47.58 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.61 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  43.73 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  43.73 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  47.95 
 
 		 331 aa  289  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.61 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  43.73 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  45.32 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.36 
 
 		 332 aa  288  8e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  48.64 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  47.43 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  44.85 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  48.25 
 
 		 334 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  48.17 
 
 		 320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  47.13 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  48.67 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  46.31 
 
 		 339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.19 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  44.35 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.72 
 
 		 337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  48.25 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  48.25 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  47.95 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  48.48 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  46.83 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  45.45 
 
 		 322 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  48.25 
 
 		 334 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  45.62 
 
 		 327 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  46.15 
 
 		 338 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  46.5 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  47.95 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  44.91 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.36 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  43.5 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  45.99 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  47.06 
 
 		 334 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  46.76 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  45.15 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  45.45 
 
 		 336 aa  279  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  49.39 
 
 		 328 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  45.59 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  46.34 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  46.55 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.59 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.59 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  45.59 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  45.59 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  45.59 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  43.27 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  46.36 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  45.59 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.59 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  45.9 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  46.36 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  45.81 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.59 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.11 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  45.29 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.26 
 
 		 469 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  45.29 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  46.08 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>