More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1605 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  100 
 
 		 348 aa  702    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  84.84 
 
 		 342 aa  570  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  62.97 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  62.16 
 
 		 341 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  64.65 
 
 		 348 aa  411  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  61.63 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  62.8 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  62.5 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  57.19 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  55.96 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  54.01 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  51.83 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  50.9 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  50.15 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  50.15 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  47.94 
 
 		 333 aa  311  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  47.94 
 
 		 333 aa  311  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2771  Transketolase central region  51.34 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  47.63 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  47.34 
 
 		 340 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  47.34 
 
 		 340 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  47.48 
 
 		 339 aa  299  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  48.62 
 
 		 320 aa  299  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  47.35 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  50.3 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  47.77 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  47.67 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  46.77 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  44.51 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.34 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  47.65 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  47.04 
 
 		 338 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  45.95 
 
 		 344 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.95 
 
 		 344 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  45.66 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.95 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.95 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  49.69 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.66 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  45.66 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.66 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  47.9 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.59 
 
 		 480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.38 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  43.6 
 
 		 325 aa  282  7.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  46.5 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.66 
 
 		 344 aa  281  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  47.27 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.97 
 
 		 497 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  45.65 
 
 		 327 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.87 
 
 		 459 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  46.75 
 
 		 335 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  47.09 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  47.37 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  46.75 
 
 		 340 aa  278  9e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.12 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  45.34 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  44.28 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  44.21 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  48.37 
 
 		 334 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  44.98 
 
 		 332 aa  275  7e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.09 
 
 		 467 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.82 
 
 		 465 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  45.95 
 
 		 341 aa  275  9e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  48.37 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  46.58 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  46.48 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  48.07 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  47.63 
 
 		 340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  47.37 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  47.77 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  42.38 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.58 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.58 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  46.58 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  46.58 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  46.58 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.58 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.58 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  46.58 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.67 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.53 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  48.52 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.38 
 
 		 460 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  48.07 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  48.07 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.53 
 
 		 448 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  45.4 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  46.27 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  46.18 
 
 		 328 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  45.83 
 
 		 336 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.85 
 
 		 456 aa  271  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.84 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  45.96 
 
 		 327 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  44.95 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.26 
 
 		 451 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.64 
 
 		 482 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  43.16 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  44.34 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  48.07 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>