More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2771 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2771  Transketolase central region  100 
 
 
339 aa  677    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  54.41 
 
 
348 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  52.41 
 
 
347 aa  335  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  53.51 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  50.59 
 
 
341 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  50.6 
 
 
346 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  51.34 
 
 
348 aa  309  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  49.55 
 
 
332 aa  301  1e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  52.32 
 
 
339 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  50.62 
 
 
342 aa  296  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.51 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  45.89 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  44.83 
 
 
337 aa  288  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  45.48 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  45.48 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  45.65 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  45.03 
 
 
327 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  45.03 
 
 
327 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  47.32 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  45.92 
 
 
339 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  44.14 
 
 
337 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  45.12 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  43.56 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  43.11 
 
 
346 aa  252  7e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  44.28 
 
 
340 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  45.21 
 
 
344 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  42.47 
 
 
340 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  41.87 
 
 
341 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  42.47 
 
 
340 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  42.34 
 
 
342 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  42.63 
 
 
324 aa  249  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  45.76 
 
 
334 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  43.52 
 
 
327 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  44.71 
 
 
340 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  42.77 
 
 
339 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  43.21 
 
 
336 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  43.67 
 
 
337 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  44.79 
 
 
334 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  42.17 
 
 
340 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  41.8 
 
 
327 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  43.21 
 
 
327 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  41.8 
 
 
327 aa  247  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  43.3 
 
 
327 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  44.68 
 
 
338 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.64 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.64 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  43.67 
 
 
335 aa  245  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  40.35 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  42.65 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.35 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  44.34 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  40.81 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  43.87 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.35 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  44.65 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  43.64 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  40.71 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  42.63 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  40.06 
 
 
344 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.06 
 
 
344 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.06 
 
 
344 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  43.84 
 
 
334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  40.06 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  39.06 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  40.06 
 
 
344 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  43.51 
 
 
326 aa  242  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.38 
 
 
459 aa  242  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  40.06 
 
 
322 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  43.56 
 
 
334 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  43.56 
 
 
334 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  39.38 
 
 
791 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.25 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.5 
 
 
449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  44.13 
 
 
327 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  44.13 
 
 
327 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  44.13 
 
 
327 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  44.13 
 
 
327 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  44.13 
 
 
327 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  44.13 
 
 
327 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  43.56 
 
 
334 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  44.13 
 
 
327 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  40.96 
 
 
339 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.24 
 
 
332 aa  239  5e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.51 
 
 
469 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.82 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  44.38 
 
 
335 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.32 
 
 
467 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.82 
 
 
465 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  43.81 
 
 
327 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  43.67 
 
 
327 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  39.81 
 
 
325 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  43.49 
 
 
327 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  43.49 
 
 
327 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1077  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  40.87 
 
 
327 aa  236  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  43.49 
 
 
327 aa  237  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.25 
 
 
461 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.06 
 
 
465 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.25 
 
 
448 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  42.06 
 
 
328 aa  236  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  43.07 
 
 
339 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>