More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0667 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  100 
 
 		 350 aa  713    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  60.12 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  59.7 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  59.64 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  56.48 
 
 		 348 aa  401  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  61.45 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  56.57 
 
 		 341 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  55.86 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  56.2 
 
 		 348 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  54.01 
 
 		 348 aa  361  8e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  54.6 
 
 		 342 aa  358  9.999999999999999e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  50.77 
 
 		 324 aa  331  9e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  46.39 
 
 		 332 aa  315  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  48.95 
 
 		 339 aa  305  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  46.57 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  46.57 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  47.51 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  46.53 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  46.53 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  46.53 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  47.75 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  48.05 
 
 		 339 aa  291  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  47.62 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  45.51 
 
 		 341 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  45.72 
 
 		 334 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  47.54 
 
 		 340 aa  282  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  44.48 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  44.48 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  45.95 
 
 		 335 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  45.48 
 
 		 338 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  47.55 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.98 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  46.58 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2771  Transketolase central region  45.89 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  43.73 
 
 		 344 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.73 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.73 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.44 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.44 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.44 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.44 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  43.44 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  44.8 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.44 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  44.16 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  43.15 
 
 		 344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  46.51 
 
 		 339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  43.85 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  45.65 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  45.4 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  43.11 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  45.05 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  45.96 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  42.27 
 
 		 337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  46.02 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.55 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  46.61 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  45.59 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  46.02 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  47.45 
 
 		 334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  46.02 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  44.81 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.72 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  44.41 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.65 
 
 		 324 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  44.21 
 
 		 320 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  44.24 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  46.02 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  46.02 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  43.16 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  41.99 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  44.11 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  44.71 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.81 
 
 		 448 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  46.42 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  42.47 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  45.65 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  45.65 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.71 
 
 		 461 aa  262  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  45.32 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  42.37 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  43.03 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  40.79 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.21 
 
 		 465 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.2 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  43.81 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  43.26 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  44.89 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  44.44 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.34 
 
 		 467 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  43.38 
 
 		 326 aa  258  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.44 
 
 		 456 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  41.6 
 
 		 791 aa  256  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  42.24 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  42.24 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  42.24 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  42.24 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  42.24 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  42.55 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  42.24 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>