More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3730 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  100 
 
 		 340 aa  698    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  78.82 
 
 		 340 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  79.88 
 
 		 335 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  78.38 
 
 		 338 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  76.49 
 
 		 337 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  71.99 
 
 		 334 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  69.37 
 
 		 340 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  69.37 
 
 		 340 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  69.37 
 
 		 340 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  67.87 
 
 		 339 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  73.11 
 
 		 334 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  73.19 
 
 		 334 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  72.81 
 
 		 334 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  72.59 
 
 		 334 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  66.67 
 
 		 339 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  71.99 
 
 		 334 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  69.88 
 
 		 334 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  71.99 
 
 		 334 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  71.99 
 
 		 334 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  67.87 
 
 		 339 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  71.99 
 
 		 334 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  66.37 
 
 		 333 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  66.67 
 
 		 333 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  65.86 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  66.46 
 
 		 341 aa  435  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  60.71 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  63.72 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  58.33 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  59.58 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  58.04 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  58.04 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  58.04 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  58.04 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  57.74 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  58.04 
 
 		 344 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  58.28 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  57.74 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  57.44 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  57.14 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  56.85 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7509  transketolase central region  56.89 
 
 		 335 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  54.93 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  53.94 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  51.84 
 
 		 346 aa  337  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  51.2 
 
 		 324 aa  332  8e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  52.08 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  52.08 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  48.27 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  49.54 
 
 		 320 aa  295  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  45.65 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  45.65 
 
 		 338 aa  285  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  46.15 
 
 		 342 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  43.03 
 
 		 341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  46.75 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  45.54 
 
 		 337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  46.55 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  42.94 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  45.59 
 
 		 791 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  44.08 
 
 		 348 aa  279  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  40.64 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  44.98 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  41.92 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  45.48 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  42.55 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  41.79 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  45.18 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  41.32 
 
 		 325 aa  272  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.12 
 
 		 465 aa  272  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  42.9 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  44.31 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  43.67 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  46.46 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  43.12 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  43.4 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.68 
 
 		 448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  44.58 
 
 		 342 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  42.09 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.38 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  43.67 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  44.74 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  43.98 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.67 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  43.67 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.67 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.67 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.67 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  43.67 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.67 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  44.17 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  44.17 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  40.66 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.67 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  40.9 
 
 		 327 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  44.62 
 
 		 328 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  43.87 
 
 		 324 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  44.48 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  45.57 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  44.68 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  42.34 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.37 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>