More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1212 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1212  transketolase, central region  100 
 
 		 332 aa  672    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  55.8 
 
 		 346 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  52.29 
 
 		 347 aa  345  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  52.29 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1518  Transketolase central region  52.29 
 
 		 339 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4030  Transketolase central region  51.51 
 
 		 342 aa  337  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3051  TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  51.1 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0710212  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1605  Transketolase central region  51.83 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  50.76 
 
 		 341 aa  335  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  51.38 
 
 		 348 aa  332  6e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2932  transketolase central region  49.22 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.911971 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  49.85 
 
 		 324 aa  319  5e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0667  transketolase, central region  46.39 
 
 		 350 aa  315  9e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2771  Transketolase central region  49.55 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  44.14 
 
 		 333 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  44.14 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  44.58 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  43.53 
 
 		 340 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  43.53 
 
 		 340 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  46.27 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  42.94 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  43.41 
 
 		 339 aa  278  9e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  44.02 
 
 		 342 aa  278  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  43.49 
 
 		 339 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  44.04 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  42.69 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  42.69 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  42.4 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  42.4 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  42.4 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  42.4 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  42.4 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  45.87 
 
 		 334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  45.95 
 
 		 334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  42.4 
 
 		 344 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  45.87 
 
 		 334 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  42.11 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  43.92 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  45.05 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  41.23 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  41.81 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  43.2 
 
 		 338 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  42.23 
 
 		 336 aa  265  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  42.01 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  45.96 
 
 		 334 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3730  Transketolase central region  42.94 
 
 		 340 aa  264  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.98943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  46.27 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  45.65 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  45.65 
 
 		 334 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  43.24 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  45.65 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  45.65 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  42.47 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  42.22 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  43.37 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  43.37 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  43.07 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  43.21 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  44.28 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  40.79 
 
 		 324 aa  255  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  42.64 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44 
 
 		 328 aa  255  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  44.34 
 
 		 338 aa  255  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  42.59 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  44.14 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  41.1 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  43.48 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  41.85 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  43.11 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  42.07 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  42.07 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  41.19 
 
 		 337 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  42.9 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  42.17 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  40.06 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  40.94 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  42.77 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  42.94 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  46.71 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  41.05 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  41.05 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  42.59 
 
 		 327 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  42.17 
 
 		 320 aa  248  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  40.31 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1438  Transketolase central region  45.54 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  41.77 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  43.87 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  41.54 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  41.87 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  41.44 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  41.49 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  39.64 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  42.28 
 
 		 320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  42.24 
 
 		 325 aa  245  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  39.88 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  41.54 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  40 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  39.64 
 
 		 325 aa  245  9e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  43.56 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  39.81 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>