More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1047 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1047  transketolase, central region  100 
 
 		 327 aa  650    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0574878  normal  0.0597249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5071  Transketolase central region  51.68 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.067721  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  52.19 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  49.38 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  48.91 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  48.3 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1944  Transketolase central region  52.52 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  48.3 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  47.48 
 
 		 320 aa  286  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  51.06 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  48.28 
 
 		 346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  45.73 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  45.73 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  46.48 
 
 		 331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  47.85 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  46.34 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  47.15 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21360  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  45.71 
 
 		 348 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  47.06 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  46.58 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  46.75 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  48.48 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  47.48 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  46.75 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  46.75 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  45.85 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  48.77 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  45.37 
 
 		 327 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  45.99 
 
 		 327 aa  276  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  49.08 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.31 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.08 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  45.6 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  47.15 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  47.37 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3770  transketolase, central region  44.82 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  44.95 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  45.81 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  45.81 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  45.06 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  45.18 
 
 		 337 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  46.97 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  48.22 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.12 
 
 		 332 aa  271  8.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  45.51 
 
 		 340 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  46.93 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  47.27 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  45.03 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  48.45 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1750  transketolase central region  45.48 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  47.18 
 
 		 336 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  43.48 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3966  transketolase  45.05 
 
 		 346 aa  269  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  44.89 
 
 		 326 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  47.02 
 
 		 324 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.72 
 
 		 456 aa  268  7e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  44.72 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  47.4 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  45.28 
 
 		 320 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  49.09 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.96 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  44.24 
 
 		 791 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  44.65 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0912  transketolase, central region  44.28 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  47.2 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  46.69 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  46.35 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1217  Transketolase domain protein  46.79 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  47.02 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  46.06 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  44.31 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  48.18 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  44.31 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  43.49 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  44.58 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.48 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  43.03 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  44.48 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  46.58 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  48.79 
 
 		 334 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  43.79 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  46.36 
 
 		 339 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  43.79 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  47.88 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  45 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  47.88 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  44.55 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.06 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.18 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.18 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  44.89 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  48.79 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  48.18 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.18 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.18 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.18 
 
 		 344 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  46.3 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>