More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3434 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3434  Transketolase domain protein  100 
 
 		 353 aa  716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0193049  decreased coverage  0.00000789299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1056  transketolase domain-containing protein  52.24 
 
 		 330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329928  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3049  transketolase-like protein  48.14 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  47.26 
 
 		 327 aa  282  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  47.26 
 
 		 327 aa  282  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  46.41 
 
 		 344 aa  278  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  46.41 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.41 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.41 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.41 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.11 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  46.11 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.11 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  46.11 
 
 		 344 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  45.81 
 
 		 344 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  44.85 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  46.15 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  45.97 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  45.26 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  45.26 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  47.13 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41740  acetoin:2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit AcoB  44.21 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0225699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  45.67 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0120  transketolase central region  45.05 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  42.99 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  43.67 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  45.35 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0599  transketolase central region  45.35 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315571  normal  0.029192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0554  acetoin dehydrogenase, beta subunit  45.35 
 
 		 340 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.246222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  45.45 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  43.77 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  44.67 
 
 		 337 aa  255  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  42.06 
 
 		 327 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2325  acetoin dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.37 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  43.29 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  42.38 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.79 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  42.17 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10250  acetoin catabolism protein AcoB  45.45 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  45.18 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  42.46 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  42.55 
 
 		 325 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  42.33 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  42.25 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0314  acetoin dehydrogenase, beta subunit  43.58 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4080  Transketolase domain protein  43.16 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1217  Transketolase domain protein  43.24 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5919  Transketolase central region  43.54 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  42.86 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  40.85 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  42.68 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1088  Transketolase central region  42.31 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.589015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  42.73 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  41.74 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1438  Transketolase central region  46.48 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  42.73 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  42.02 
 
 		 328 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7509  transketolase central region  44.38 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0347  transketolase, central region  41.98 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1035  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  41.95 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  42.12 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  43.94 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  44.44 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  42.94 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  42.02 
 
 		 325 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4044  transketolase central region  43.54 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.378362  normal  0.0657441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5551  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  44.62 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  42.25 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3449  Transketolase domain protein  43.87 
 
 		 346 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.85 
 
 		 464 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1749  transketolase central region  42.47 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374866  normal  0.0546828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0344  acetoin:DCPIP oxidoreductase beta subunit  44.17 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  41.52 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  42.94 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  39.7 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5139  acetoin/2,6-dichlorophenolindophenol oxidoreductase beta subunit  42.17 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0912103  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.88 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1435  transketolase central region  42.17 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1862  transketolase central region  42.17 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0703587  hitchhiker  0.00590609 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  41.51 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  41.72 
 
 		 657 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  40.3 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  42.25 
 
 		 332 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.79 
 
 		 483 aa  233  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6241  transketolase, central region  42.17 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.11 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1838  transketolase, central region  42.17 
 
 		 334 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  41.64 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4984  transketolase, central region  41.69 
 
 		 335 aa  232  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  41.77 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.56 
 
 		 459 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.62 
 
 		 463 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.62 
 
 		 463 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  39.02 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  42.11 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  41.03 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  43.34 
 
 		 675 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  39.16 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  40.79 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0746  Transketolase central region  42.25 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>