More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3953 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
237 aa  477  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  89.7 
 
 
236 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  89.27 
 
 
236 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  73.25 
 
 
230 aa  338  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  72.93 
 
 
239 aa  334  9e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  69.47 
 
 
232 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  70.39 
 
 
225 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  55.35 
 
 
325 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  52.09 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  51.17 
 
 
325 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
325 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.36 
 
 
231 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
325 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
325 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.23 
 
 
230 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 
325 aa  208  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
325 aa  208  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.13 
 
 
230 aa  207  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
344 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
327 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.79 
 
 
231 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
325 aa  205  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  48.83 
 
 
325 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  50.93 
 
 
325 aa  204  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.17 
 
 
231 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.92 
 
 
231 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  49.3 
 
 
325 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
325 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 
325 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.7 
 
 
231 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  48.03 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.39 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  39.83 
 
 
338 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  40.67 
 
 
333 aa  148  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 
353 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  36.84 
 
 
338 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  38.68 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  30.48 
 
 
386 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 
286 aa  95.1  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  31.31 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
282 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 
285 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
293 aa  92.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 
284 aa  92.4  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
294 aa  92  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
283 aa  90.9  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
283 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.63 
 
 
282 aa  89  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 
289 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30.62 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 
287 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
282 aa  82  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
300 aa  81.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  28.7 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  32.11 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  28.71 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  31.55 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
286 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  32.6 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  32 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  29.78 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  28.02 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  28.64 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
291 aa  72  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
281 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
280 aa  71.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  32.46 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  31.05 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>