More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0803 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
325 aa  651    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  73.21 
 
 
325 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  63.32 
 
 
325 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  63.32 
 
 
325 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  62.85 
 
 
325 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  64.29 
 
 
330 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  62.73 
 
 
325 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  61.3 
 
 
325 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  61.85 
 
 
325 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  61.3 
 
 
325 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  60.68 
 
 
325 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  61.66 
 
 
325 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  61.96 
 
 
325 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  62.11 
 
 
327 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  60.68 
 
 
324 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  65.19 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
325 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.22 
 
 
230 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.55 
 
 
231 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.25 
 
 
231 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.56 
 
 
231 aa  232  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.56 
 
 
231 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.14 
 
 
231 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  55.37 
 
 
331 aa  228  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.16 
 
 
231 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  54.75 
 
 
230 aa  225  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.54 
 
 
230 aa  206  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.24 
 
 
237 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.18 
 
 
239 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
236 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.12 
 
 
232 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
236 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.41 
 
 
225 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  36.5 
 
 
338 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 
353 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
337 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.78 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  30.24 
 
 
386 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
288 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 
282 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.55 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
284 aa  95.9  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
286 aa  95.9  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  29.96 
 
 
288 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
288 aa  92.4  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
289 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  33.07 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
290 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.82 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5474  ATP phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.65 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2174  ATP phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  26.86 
 
 
213 aa  79  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
554 aa  79.3  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  32.57 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0560  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.1 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  27.8 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1964  ATP phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
206 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.81 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
283 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.07 
 
 
212 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  31.28 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05861  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.47 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.138648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.24 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2027  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.88 
 
 
223 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0111404 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0363  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.58 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.99 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0391  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.58 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0393  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.58 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  27.42 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2919  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.98 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>