More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1745 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  69.47 
 
 		 285 aa  411  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  69.58 
 
 		 300 aa  401  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  60.75 
 
 		 300 aa  363  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 		 286 aa  355  5e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  51.56 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  51.58 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  51.86 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  38.11 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 		 282 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  36.55 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  38.23 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  37.12 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  36.12 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 290 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  36.79 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 299 aa  148  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  38.81 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  34.48 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  31.44 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>