More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1309 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 282 aa  567  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  79.08 
 
 		 282 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  75.53 
 
 		 282 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  74.47 
 
 		 282 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  72.7 
 
 		 280 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  67.25 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  66.78 
 
 		 284 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 		 285 aa  363  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  62.77 
 
 		 281 aa  362  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  63.6 
 
 		 284 aa  362  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  62.41 
 
 		 284 aa  358  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 		 283 aa  358  5e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  62.59 
 
 		 285 aa  354  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  63.73 
 
 		 282 aa  352  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  59.52 
 
 		 288 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  58.87 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  57.09 
 
 		 283 aa  335  7e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  58.89 
 
 		 287 aa  332  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  61.46 
 
 		 287 aa  328  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 		 281 aa  322  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  56.38 
 
 		 281 aa  321  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  57.09 
 
 		 282 aa  319  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  57.45 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  55.44 
 
 		 287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 		 281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 		 281 aa  311  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 		 284 aa  299  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  53.19 
 
 		 281 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  54.06 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  53.9 
 
 		 281 aa  295  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  54.58 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 		 283 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 		 283 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  38.25 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  34.92 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  35.59 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  33.56 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  34.84 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  46.08 
 
 		 217 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  29.97 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  26.86 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  27.02 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>