More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67165 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  100 
 
 
304 aa  624  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  57.56 
 
 
307 aa  354  7.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  52.1 
 
 
357 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  46.31 
 
 
295 aa  276  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.25 
 
 
282 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
286 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  36.12 
 
 
284 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 
292 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 
282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 
284 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
282 aa  162  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
283 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
283 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
282 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
284 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
288 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  34.11 
 
 
285 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
283 aa  152  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
284 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
287 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
280 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
282 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 
289 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
282 aa  146  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
281 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
284 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
294 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 
281 aa  142  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
281 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.33 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
299 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
288 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
285 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
281 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
283 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
300 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
283 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  35.74 
 
 
282 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
283 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
282 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
281 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  34.32 
 
 
300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
286 aa  136  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
284 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
281 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
293 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 
281 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
298 aa  128  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.31 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 
306 aa  127  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
304 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
285 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
299 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
299 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
299 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
299 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
331 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
324 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
299 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
293 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
299 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 
286 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  31.35 
 
 
332 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
299 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
286 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
299 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
299 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  31.13 
 
 
299 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
299 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
299 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 
288 aa  123  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  29.59 
 
 
288 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
299 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
299 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
299 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>