More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1863 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
282 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  81.91 
 
 
282 aa  457  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  74.47 
 
 
282 aa  425  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  75.89 
 
 
282 aa  425  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  75.18 
 
 
280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  70.03 
 
 
286 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  70.53 
 
 
284 aa  394  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  65.6 
 
 
281 aa  371  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  67.26 
 
 
285 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  64.54 
 
 
284 aa  360  2e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  65.03 
 
 
285 aa  358  7e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  61.7 
 
 
281 aa  353  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  62.24 
 
 
287 aa  350  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  61.94 
 
 
288 aa  348  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  62.06 
 
 
284 aa  348  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  60.92 
 
 
283 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 
282 aa  333  1e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  60.64 
 
 
294 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  58.6 
 
 
287 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
282 aa  329  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
281 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
287 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  59.22 
 
 
287 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
281 aa  322  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
281 aa  315  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  55.32 
 
 
281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  55.32 
 
 
281 aa  301  9e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  54.06 
 
 
288 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  52.48 
 
 
281 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  52.82 
 
 
283 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 
283 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 
283 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  39.65 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  34.34 
 
 
304 aa  163  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  35.69 
 
 
307 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  34.23 
 
 
357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
292 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
286 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  34.05 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.07 
 
 
294 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
284 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 
300 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 
293 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
299 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  31.32 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
290 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
299 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
298 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.28 
 
 
284 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
288 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 
287 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
290 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
282 aa  122  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 
299 aa  122  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
288 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
289 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
297 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
293 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
299 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 
299 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
300 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
299 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
299 aa  118  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
291 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>