More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2150 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 281 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  74.73 
 
 		 281 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  74.38 
 
 		 281 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  72.54 
 
 		 284 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  73.85 
 
 		 283 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  72.7 
 
 		 288 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  73.5 
 
 		 283 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  73.5 
 
 		 283 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  69.4 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  68.33 
 
 		 281 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  59.64 
 
 		 285 aa  331  9e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  59.43 
 
 		 284 aa  325  7e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 		 286 aa  322  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 		 282 aa  322  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  57.39 
 
 		 284 aa  322  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 281 aa  322  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 		 294 aa  321  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  58.87 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  56.03 
 
 		 282 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  56.84 
 
 		 285 aa  315  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 		 281 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  57.3 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 288 aa  311  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 281 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  57.19 
 
 		 287 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  54.26 
 
 		 283 aa  308  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  54.61 
 
 		 282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  57.24 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  54.58 
 
 		 287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  55.32 
 
 		 282 aa  301  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  56.64 
 
 		 287 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  51.06 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  33.56 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  32.39 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  33.44 
 
 		 357 aa  138  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  33.56 
 
 		 304 aa  132  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.21 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  36.99 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.25 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  32.07 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0381  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.01 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>