More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3057 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
281 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  89.36 
 
 
288 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  87.28 
 
 
283 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  87.63 
 
 
283 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  87.63 
 
 
283 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  83.8 
 
 
284 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  74.73 
 
 
281 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  74.73 
 
 
281 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  70.46 
 
 
287 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  68.33 
 
 
281 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 
284 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  54.58 
 
 
284 aa  310  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 
285 aa  310  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
286 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  55.52 
 
 
281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 
282 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  54.45 
 
 
281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  53.55 
 
 
282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
283 aa  301  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  53.38 
 
 
281 aa  301  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  52.67 
 
 
284 aa  298  9e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  53.19 
 
 
282 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 
281 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  54.77 
 
 
282 aa  295  6e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
285 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  52.48 
 
 
282 aa  292  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
288 aa  291  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  52.31 
 
 
280 aa  291  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 
282 aa  288  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  51.06 
 
 
287 aa  288  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
287 aa  281  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
283 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 
283 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  36 
 
 
286 aa  159  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  32.55 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  32.04 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  35.67 
 
 
357 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 
293 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  40.89 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
286 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
285 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.46 
 
 
294 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.55 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  33 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
282 aa  125  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
288 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
294 aa  122  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  35.69 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
303 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
299 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
298 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 
337 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 
299 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.39 
 
 
282 aa  112  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
299 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
294 aa  112  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
297 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>