More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1731 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
282 aa  555  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  76.24 
 
 
282 aa  434  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  75.53 
 
 
282 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  75.89 
 
 
282 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  69.5 
 
 
280 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  66.19 
 
 
285 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  63.83 
 
 
281 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  65.16 
 
 
286 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  65.38 
 
 
284 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 
288 aa  349  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  61.35 
 
 
284 aa  345  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  62.41 
 
 
284 aa  345  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  61.54 
 
 
285 aa  344  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 
283 aa  341  5.999999999999999e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 
282 aa  338  5e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
281 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  59.93 
 
 
283 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 
287 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  59.57 
 
 
282 aa  331  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
294 aa  322  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
281 aa  320  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
281 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  56.84 
 
 
287 aa  316  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
287 aa  310  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  54.61 
 
 
281 aa  305  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  54.26 
 
 
281 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
281 aa  292  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 
288 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  50.71 
 
 
281 aa  288  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  51.58 
 
 
284 aa  288  8e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  50.35 
 
 
283 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 
283 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 
283 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  36.36 
 
 
295 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  36.58 
 
 
307 aa  158  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 
286 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  33.33 
 
 
304 aa  156  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  34.68 
 
 
357 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
285 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  37.15 
 
 
294 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
285 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
292 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 
284 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
286 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 
293 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 
295 aa  123  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 
289 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 
293 aa  122  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  30.31 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
291 aa  115  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  27.62 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
293 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  27.87 
 
 
294 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
284 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
294 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  27.18 
 
 
291 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
286 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
283 aa  112  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
298 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  29.35 
 
 
299 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
305 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
299 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  30.35 
 
 
337 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
304 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 
294 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
288 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
289 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
299 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
290 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 
290 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
288 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
282 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  27.05 
 
 
299 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>