More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3596 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  77.51 
 
 
289 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  74.65 
 
 
290 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  59.17 
 
 
310 aa  368  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  60.14 
 
 
294 aa  364  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  59.44 
 
 
294 aa  363  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  60.14 
 
 
294 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  60.14 
 
 
294 aa  358  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  60.14 
 
 
292 aa  358  8e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 
294 aa  353  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  56.29 
 
 
291 aa  348  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 
297 aa  348  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  55.9 
 
 
293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
290 aa  328  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
286 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
291 aa  317  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  54.36 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  49.31 
 
 
290 aa  310  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  49.31 
 
 
290 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  50.52 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
291 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  55.4 
 
 
291 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  49.48 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
293 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
291 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  54.36 
 
 
294 aa  299  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
293 aa  280  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  51.56 
 
 
297 aa  277  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  49.83 
 
 
291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
290 aa  255  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
291 aa  246  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 
290 aa  239  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
290 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 
289 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  36.64 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  37.33 
 
 
300 aa  171  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 
293 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 
286 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  36.3 
 
 
282 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
288 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  38.23 
 
 
284 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 
294 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 
288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
300 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
306 aa  159  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
292 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
282 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
283 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  29.93 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
285 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.01 
 
 
294 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 
333 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.07 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
286 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  26.17 
 
 
307 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 
280 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 
281 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
281 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 
282 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  29.89 
 
 
284 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 
294 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
283 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
283 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
283 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  27.05 
 
 
282 aa  102  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 
299 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 
285 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  27.34 
 
 
287 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
304 aa  99.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>