More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1119 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
291 aa  591  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  85.22 
 
 
291 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  82.47 
 
 
291 aa  497  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  82.58 
 
 
290 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  81.1 
 
 
291 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  82.58 
 
 
290 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  78.69 
 
 
291 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 
290 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 
291 aa  363  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
293 aa  360  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
293 aa  359  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
294 aa  340  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  55.52 
 
 
293 aa  334  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  53.79 
 
 
294 aa  334  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  53.95 
 
 
294 aa  333  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
292 aa  333  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
289 aa  330  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  53.47 
 
 
294 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
297 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  52.58 
 
 
294 aa  329  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
286 aa  318  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
289 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  51.89 
 
 
291 aa  316  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  54.48 
 
 
297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
294 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
293 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  52.26 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  50.17 
 
 
291 aa  305  6e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
289 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  44.33 
 
 
291 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  45.02 
 
 
291 aa  237  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  42.96 
 
 
291 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  40.69 
 
 
290 aa  228  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 
290 aa  219  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 
288 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 
286 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
288 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 
285 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
306 aa  145  9e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
284 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
289 aa  142  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
293 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 
282 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 
282 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
300 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  27.48 
 
 
294 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 
284 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  27.3 
 
 
281 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  27.11 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  27.3 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  26.37 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  27.3 
 
 
281 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  26.69 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  27.02 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
288 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
283 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
286 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
283 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
286 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  26.69 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  26.6 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  28.03 
 
 
295 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 
284 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  25.59 
 
 
307 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
288 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  26.57 
 
 
282 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
287 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 
281 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
294 aa  105  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  28.09 
 
 
298 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  25.89 
 
 
280 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 
282 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  27.24 
 
 
282 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  26.5 
 
 
282 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  25.8 
 
 
282 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  25.53 
 
 
285 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 
282 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  26.87 
 
 
298 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
285 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  24.91 
 
 
282 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  26.46 
 
 
281 aa  99  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  24.74 
 
 
281 aa  99  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>