More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2856 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  62.32 
 
 
294 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  60.56 
 
 
292 aa  363  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 
294 aa  360  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  59.51 
 
 
297 aa  358  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  58.8 
 
 
294 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  59.51 
 
 
294 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  59.65 
 
 
291 aa  353  2.9999999999999997e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  57.75 
 
 
294 aa  350  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  59.44 
 
 
310 aa  349  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  58.8 
 
 
289 aa  344  8e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
291 aa  342  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  56.49 
 
 
291 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  54.74 
 
 
291 aa  330  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 
291 aa  330  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  55.63 
 
 
291 aa  330  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 
293 aa  330  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  56.49 
 
 
290 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  56.84 
 
 
293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  55.44 
 
 
290 aa  323  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
289 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
290 aa  322  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  58.6 
 
 
294 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  58.6 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
291 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  57.19 
 
 
293 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  52.82 
 
 
289 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 
297 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
293 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
290 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  42.66 
 
 
290 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
291 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  44.95 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
290 aa  239  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
290 aa  239  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  44.21 
 
 
291 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 
325 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
284 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  35.99 
 
 
285 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 
286 aa  159  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
289 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
288 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
300 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
288 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 
288 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
306 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
288 aa  146  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 
284 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 
285 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
294 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
282 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
296 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
287 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 
284 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
282 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
282 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
286 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 
283 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  28.62 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 
283 aa  109  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  27.24 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  29.89 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  27.37 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  28.73 
 
 
281 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  24.56 
 
 
285 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  26.69 
 
 
286 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  24.2 
 
 
286 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  28.57 
 
 
295 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 
284 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
285 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  24.2 
 
 
284 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.73 
 
 
282 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  28.12 
 
 
304 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  28.36 
 
 
288 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  25 
 
 
287 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
281 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  26.64 
 
 
285 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  26.64 
 
 
281 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
282 aa  102  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 
282 aa  102  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
283 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
283 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
333 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  28.73 
 
 
282 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
284 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  27.8 
 
 
283 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  27.37 
 
 
282 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>