More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5380 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
284 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  81.69 
 
 
284 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  69.75 
 
 
281 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  70.46 
 
 
281 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  66.2 
 
 
284 aa  381  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  65.73 
 
 
286 aa  381  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 
281 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  63.89 
 
 
288 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  66.19 
 
 
280 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  63.12 
 
 
282 aa  358  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  62.41 
 
 
282 aa  358  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  61.75 
 
 
287 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  62.06 
 
 
282 aa  348  7e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 
285 aa  346  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  62.41 
 
 
282 aa  345  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 
282 aa  344  8e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  61.57 
 
 
294 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  59.36 
 
 
283 aa  335  5.999999999999999e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  59.3 
 
 
285 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  61.57 
 
 
281 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 
287 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  58.1 
 
 
287 aa  328  9e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  60.14 
 
 
287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  59.57 
 
 
283 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 
282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  56.58 
 
 
281 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  57.3 
 
 
281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  55.28 
 
 
284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  56.23 
 
 
281 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  52.67 
 
 
281 aa  298  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  53.47 
 
 
288 aa  295  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
283 aa  291  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
283 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
283 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  38.54 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  37.32 
 
 
283 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  35.88 
 
 
357 aa  167  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  34.34 
 
 
307 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 
286 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
286 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  33.99 
 
 
304 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 
300 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 
300 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
292 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
285 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 
293 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 
282 aa  149  7e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
284 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  36.01 
 
 
294 aa  145  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
287 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
286 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  34.83 
 
 
294 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
289 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  34.06 
 
 
282 aa  142  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
285 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
288 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
288 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
295 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
217 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
288 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.27 
 
 
288 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.21 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  35.49 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 
299 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 
299 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 
299 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 
299 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 
299 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 
299 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  31.32 
 
 
284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 
305 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 
299 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
285 aa  129  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
286 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
303 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
299 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 
291 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
299 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
291 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
294 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>