More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12153 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  83.8 
 
 
283 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  83.8 
 
 
281 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  83.8 
 
 
283 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  83.8 
 
 
283 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  84.1 
 
 
288 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  74.3 
 
 
281 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  72.54 
 
 
281 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  73.24 
 
 
287 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  67.61 
 
 
281 aa  384  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  58.1 
 
 
284 aa  325  6e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  55.63 
 
 
284 aa  324  8.000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 
286 aa  322  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 
287 aa  316  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  57.04 
 
 
281 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  54.58 
 
 
281 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  55.28 
 
 
284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  54.93 
 
 
281 aa  308  8e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  54.39 
 
 
282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
282 aa  299  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
294 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 
282 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  54.93 
 
 
281 aa  299  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
280 aa  297  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
285 aa  297  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
287 aa  296  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  52.92 
 
 
288 aa  295  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
285 aa  295  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  52.28 
 
 
283 aa  294  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  54.2 
 
 
282 aa  293  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  51.58 
 
 
282 aa  288  8e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  51.93 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 
292 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 
283 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 
286 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
300 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
286 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
300 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
282 aa  143  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  34.48 
 
 
295 aa  142  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  31.23 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.46 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
217 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
295 aa  138  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  29.89 
 
 
306 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
286 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
285 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
294 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  35.33 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
284 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
288 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
288 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 
288 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  34.56 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
284 aa  126  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
282 aa  125  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 
287 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
299 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 
299 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
294 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
294 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
331 aa  118  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 
285 aa  118  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 
299 aa  118  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
299 aa  118  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>