More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0588 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 217 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 283 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 		 287 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  44.61 
 
 		 282 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  42.58 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 		 284 aa  151  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 		 281 aa  151  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  43.72 
 
 		 281 aa  151  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  42.06 
 
 		 287 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 		 281 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  46.08 
 
 		 282 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  40.89 
 
 		 281 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 		 285 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  41.31 
 
 		 284 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 		 281 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 		 285 aa  144  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 		 283 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 		 283 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 		 283 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 		 281 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 		 282 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 		 287 aa  141  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  43.17 
 
 		 288 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 292 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 		 287 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 300 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  38.37 
 
 		 284 aa  117  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 		 284 aa  111  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  38.02 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 		 293 aa  105  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 290 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 288 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  35.39 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.95 
 
 		 306 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  35.38 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  35 
 
 		 289 aa  99.8  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 285 aa  99.8  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  35.26 
 
 		 295 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 		 282 aa  98.2  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  35.36 
 
 		 289 aa  98.2  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 		 304 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 286 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 		 305 aa  95.9  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 		 282 aa  95.9  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 310 aa  95.9  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.29 
 
 		 225 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  33.16 
 
 		 304 aa  94.7  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 282 aa  94.7  9e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.6 
 
 		 285 aa  94  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.36 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 353 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 338 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 		 304 aa  92.4  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  36.53 
 
 		 294 aa  92.4  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  29.1 
 
 		 286 aa  92.4  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 292 aa  91.7  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 		 295 aa  91.7  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  27.8 
 
 		 294 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 291 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  28.18 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.84 
 
 		 338 aa  89.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2881  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.71 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 294 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  31.31 
 
 		 293 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  35.96 
 
 		 357 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3706  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.71 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3886  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.32 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1016  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.12 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3801  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.71 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 291 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 294 aa  87  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 294 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1479  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 		 291 aa  86.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>