More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3470 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
288 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  89.36 
 
 
281 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  88.3 
 
 
283 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  88.65 
 
 
283 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  88.65 
 
 
283 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  84.1 
 
 
284 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  74.47 
 
 
281 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  72.7 
 
 
281 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  70.92 
 
 
287 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  68.44 
 
 
281 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 
286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  56.18 
 
 
284 aa  318  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  57.75 
 
 
285 aa  316  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  57.75 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  54.96 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  55.99 
 
 
285 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  56.89 
 
 
294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  55.99 
 
 
287 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  54.96 
 
 
281 aa  301  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  54.42 
 
 
282 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
283 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  56.89 
 
 
281 aa  299  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 
281 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  54.06 
 
 
282 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  53.68 
 
 
287 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  54.96 
 
 
281 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  54.06 
 
 
282 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  53.47 
 
 
284 aa  295  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  54.93 
 
 
282 aa  294  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
288 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  54.61 
 
 
280 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 
282 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 
287 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 
283 aa  270  2e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  36.5 
 
 
286 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  36.3 
 
 
283 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  35.42 
 
 
292 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  35.27 
 
 
295 aa  156  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  36.7 
 
 
300 aa  149  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
284 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  32.56 
 
 
307 aa  143  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  35.69 
 
 
357 aa  142  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
285 aa  142  9e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
287 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  33.78 
 
 
304 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 
295 aa  139  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  37.81 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 
285 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
293 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
282 aa  133  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
293 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  43.17 
 
 
217 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
294 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
294 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 
299 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
293 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
288 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 
288 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
289 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.01 
 
 
288 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
304 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
299 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
332 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
299 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
299 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
299 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
331 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
294 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
299 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
284 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
299 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
299 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
299 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 
306 aa  122  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
299 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
299 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
299 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
299 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 
299 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
299 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
299 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
299 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 
298 aa  122  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
282 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
299 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
299 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
294 aa  122  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>