More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  100 
 
 		 282 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  81.91 
 
 		 282 aa  457  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  79.08 
 
 		 282 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  76.24 
 
 		 282 aa  434  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  74.82 
 
 		 280 aa  410  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  70.38 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  69.47 
 
 		 284 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  69.04 
 
 		 285 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  64.89 
 
 		 281 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  63.12 
 
 		 284 aa  358  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  61.94 
 
 		 288 aa  358  7e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  63.03 
 
 		 283 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 		 285 aa  355  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  60.99 
 
 		 281 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  63.38 
 
 		 282 aa  352  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 		 283 aa  352  4e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  62.06 
 
 		 284 aa  351  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  61.89 
 
 		 287 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  58.87 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 		 281 aa  337  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 		 294 aa  331  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  60.76 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 		 281 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  56.49 
 
 		 287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  57.09 
 
 		 281 aa  319  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 		 281 aa  318  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 		 281 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 		 281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  54.58 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  54.23 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  38.95 
 
 		 295 aa  191  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  35.69 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  35.25 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  36.36 
 
 		 357 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  37.85 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  35.31 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 285 aa  138  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  44.61 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.21 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  32.76 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.27 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  28.27 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>