More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1873 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
294 aa  593  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  90.39 
 
 
281 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  62.63 
 
 
281 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  64.06 
 
 
284 aa  357  9e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  62.99 
 
 
281 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  62.14 
 
 
285 aa  348  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  61.92 
 
 
280 aa  347  9e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  61.57 
 
 
281 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  61.57 
 
 
284 aa  342  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  59.09 
 
 
286 aa  338  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  60.07 
 
 
288 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  58.1 
 
 
284 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  58.16 
 
 
282 aa  331  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  60.64 
 
 
282 aa  330  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 
282 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  57.95 
 
 
283 aa  329  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  58.95 
 
 
287 aa  329  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  57.04 
 
 
287 aa  328  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
282 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 
287 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 
285 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
282 aa  322  4e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 
281 aa  321  8e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  55.32 
 
 
281 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  55.94 
 
 
287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  56.18 
 
 
282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
283 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
281 aa  305  8.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
281 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  56.89 
 
 
288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 
284 aa  299  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
283 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
283 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
283 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  36.97 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
283 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
286 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  34.56 
 
 
307 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.01 
 
 
286 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
285 aa  149  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 
292 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  36.12 
 
 
357 aa  148  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
300 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.86 
 
 
294 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
286 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
300 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  32.09 
 
 
304 aa  143  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
284 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
295 aa  142  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
287 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
299 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
300 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 
294 aa  135  8e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
299 aa  133  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
299 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
306 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 
297 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
291 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  29.97 
 
 
292 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
293 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 
310 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
304 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
331 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 
291 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
293 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
282 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
290 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
298 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
299 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
305 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
290 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
294 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
332 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
282 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
324 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
299 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>