More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1065 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 285 aa  568  1e-161  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  77.27 
 
 		 300 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  69.47 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  66.2 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  61.97 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  57.04 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  51.58 
 
 		 284 aa  288  9e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 		 294 aa  285  8e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  49.82 
 
 		 282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  51.75 
 
 		 282 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 		 288 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  38.49 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  37.81 
 
 		 283 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 		 294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  40.43 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  36.64 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  36.55 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  38.31 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  35.99 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 299 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  38.91 
 
 		 294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  35.82 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  34.83 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  34.46 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  29.35 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>