More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2054 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 280 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  74.82 
 
 		 282 aa  410  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  75.18 
 
 		 282 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  72.7 
 
 		 282 aa  403  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  67.96 
 
 		 284 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  67.13 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  69.5 
 
 		 282 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  67.26 
 
 		 281 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  66.19 
 
 		 284 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  65 
 
 		 285 aa  355  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  65.12 
 
 		 284 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  61.81 
 
 		 288 aa  351  8e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  65.6 
 
 		 282 aa  349  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  61.92 
 
 		 294 aa  347  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  63.35 
 
 		 281 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  59.36 
 
 		 283 aa  343  1e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  60.7 
 
 		 287 aa  342  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  61.21 
 
 		 281 aa  341  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  62.81 
 
 		 285 aa  340  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  61.57 
 
 		 281 aa  339  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  63.76 
 
 		 287 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  59.15 
 
 		 287 aa  331  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  59.07 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  58.87 
 
 		 283 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  58.36 
 
 		 281 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  59.07 
 
 		 287 aa  315  7e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 		 281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  55.52 
 
 		 281 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  54.61 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  52.31 
 
 		 281 aa  291  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  53.36 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  53.36 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  53.36 
 
 		 283 aa  288  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  39.65 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  35.57 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  35.91 
 
 		 357 aa  155  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  33.67 
 
 		 304 aa  151  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  37.63 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  33.21 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  35.86 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 305 aa  138  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 299 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 299 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  34.83 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 		 304 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.01 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>