More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1400 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
283 aa  549  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
282 aa  297  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  52.65 
 
 
282 aa  295  5e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
282 aa  295  5e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
286 aa  265  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 
285 aa  263  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  37.94 
 
 
300 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 
300 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  36.33 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
293 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
282 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
286 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
288 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
288 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
284 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
292 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
284 aa  162  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
294 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  38.52 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
285 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
282 aa  155  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
284 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.9 
 
 
294 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 
290 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 
283 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
291 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
290 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  34.77 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
292 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
299 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
295 aa  132  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
289 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
290 aa  128  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 
299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
294 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 
285 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
298 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
294 aa  125  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
298 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  31.31 
 
 
298 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
294 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
300 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
297 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
294 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
331 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 
299 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 
299 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
299 aa  122  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 
299 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 
281 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
332 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
299 aa  118  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
299 aa  118  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
299 aa  118  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
299 aa  118  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
299 aa  118  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
299 aa  118  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>