More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2452 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 287 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  63.16 
 
 		 281 aa  361  6e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  63.86 
 
 		 284 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  62.37 
 
 		 286 aa  358  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  61.75 
 
 		 284 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  59.3 
 
 		 281 aa  352  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 		 284 aa  352  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  62.24 
 
 		 282 aa  350  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  61.89 
 
 		 282 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 		 285 aa  346  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  60.7 
 
 		 280 aa  342  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  61.32 
 
 		 282 aa  342  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  60.35 
 
 		 281 aa  342  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  58.54 
 
 		 287 aa  338  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  60.21 
 
 		 285 aa  334  9e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 		 282 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  58.89 
 
 		 282 aa  332  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  59.3 
 
 		 281 aa  330  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  58.95 
 
 		 294 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  56.49 
 
 		 282 aa  328  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  57.88 
 
 		 288 aa  325  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  61.51 
 
 		 287 aa  322  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 		 284 aa  316  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  55.24 
 
 		 283 aa  312  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  57.19 
 
 		 281 aa  311  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  54.2 
 
 		 283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 		 281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  55.99 
 
 		 288 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  53.68 
 
 		 287 aa  295  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  53.68 
 
 		 283 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  53.68 
 
 		 283 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  53.68 
 
 		 283 aa  288  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  35.42 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  33.44 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  38.44 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  35.79 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  32.11 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  34.72 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  27.62 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 		 217 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  29.62 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  32.08 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>