More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4055 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  64.36 
 
 		 293 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  70.38 
 
 		 293 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  64.11 
 
 		 291 aa  387  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  63.76 
 
 		 293 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 		 291 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  59.31 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  59.31 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  58.19 
 
 		 291 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  58.54 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  59.93 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  63.41 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  63.76 
 
 		 294 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  57.09 
 
 		 294 aa  358  8e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  57.79 
 
 		 310 aa  354  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  61.94 
 
 		 297 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 		 294 aa  348  8e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  55.4 
 
 		 292 aa  345  5e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  55.05 
 
 		 297 aa  342  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 		 294 aa  340  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 		 294 aa  338  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  53.82 
 
 		 289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  56.49 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 		 289 aa  328  9e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 293 aa  319  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 		 291 aa  316  3e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 		 290 aa  311  9e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  50.69 
 
 		 289 aa  291  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 		 290 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  40.77 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  44.06 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.47 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  28.96 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  26.92 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  26.43 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  28.01 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  27.24 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  30.22 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  27.62 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  26.22 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  23.02 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  26.49 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  26.6 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  25.98 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  27.62 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  26.33 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0991  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.81 
 
 		 206 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  25.91 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  25.71 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>