More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2223 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 297 aa  599  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  88.78 
 
 		 294 aa  533  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  87.93 
 
 		 294 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  84.69 
 
 		 294 aa  517  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  86.99 
 
 		 292 aa  519  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  85.03 
 
 		 294 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  84.69 
 
 		 294 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  67.93 
 
 		 310 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  58.82 
 
 		 291 aa  362  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  59.51 
 
 		 286 aa  358  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 		 289 aa  348  6e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 		 289 aa  345  6e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  55.05 
 
 		 290 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 291 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 291 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 291 aa  332  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 		 290 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  56.64 
 
 		 290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 293 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 		 289 aa  321  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  54.64 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  56.36 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 291 aa  305  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 		 297 aa  298  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 		 293 aa  278  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  49.14 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  44.29 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  40.14 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  35.79 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  27.8 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  27.99 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.87 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1769  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.94 
 
 		 217 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.22 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  25.94 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>