More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2169 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  91.75 
 
 		 294 aa  545  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  90.69 
 
 		 294 aa  540  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  91.03 
 
 		 294 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  91.67 
 
 		 294 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  86.99 
 
 		 297 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  85.91 
 
 		 294 aa  512  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  67.13 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  60.56 
 
 		 286 aa  363  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  60.49 
 
 		 289 aa  360  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  60.14 
 
 		 289 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 		 291 aa  351  8.999999999999999e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  55.4 
 
 		 290 aa  345  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  60.49 
 
 		 290 aa  342  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  55.48 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  54.86 
 
 		 291 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  53.77 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  53.31 
 
 		 290 aa  326  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 		 289 aa  320  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 		 293 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  55.67 
 
 		 293 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 294 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  49.83 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  50.52 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  43.25 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 		 290 aa  228  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  36.33 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  35.97 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 282 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 282 aa  136  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  28.57 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  29.97 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  30.31 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  29.62 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.12 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  27.87 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  29.76 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>