More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0740 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  99.66 
 
 		 290 aa  584  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 290 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  84.67 
 
 		 291 aa  502  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  81.53 
 
 		 291 aa  494  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  81.88 
 
 		 291 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  82.58 
 
 		 291 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  80.49 
 
 		 291 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  59.31 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  59.17 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  62.02 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  57.49 
 
 		 291 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  57.49 
 
 		 293 aa  348  7e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  55.75 
 
 		 294 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  56.79 
 
 		 294 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  54.36 
 
 		 294 aa  329  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  54.01 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  53.31 
 
 		 292 aa  326  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 310 aa  325  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  55.75 
 
 		 293 aa  325  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 		 294 aa  324  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 		 286 aa  322  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 289 aa  317  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  49.31 
 
 		 289 aa  310  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 293 aa  309  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  49.83 
 
 		 291 aa  299  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 		 289 aa  278  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  44.48 
 
 		 291 aa  234  9e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  40.14 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  40.69 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  38.75 
 
 		 290 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  38.75 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.02 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  26.82 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  26.86 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  27.37 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  28.18 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  25.77 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  28.62 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  27.24 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  27.3 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  25.98 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  25.98 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  25.27 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  25.98 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  25.78 
 
 		 280 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  26.44 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  26.92 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  24.05 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  24.67 
 
 		 307 aa  99.8  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  25.35 
 
 		 287 aa  98.6  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>