More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0134 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
290 aa  589  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  78.89 
 
 
290 aa  478  1e-134  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  75.43 
 
 
290 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  61.03 
 
 
290 aa  358  6e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 
291 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
291 aa  301  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  49.83 
 
 
291 aa  293  3e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
286 aa  261  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
289 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
310 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  42.76 
 
 
291 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
291 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
293 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
290 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
291 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
291 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
293 aa  238  8e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 
294 aa  235  7e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  40.14 
 
 
290 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 
294 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
297 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  45.21 
 
 
297 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
294 aa  229  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
292 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
294 aa  224  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  39.93 
 
 
291 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
293 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
291 aa  216  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  40.69 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 
291 aa  206  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  37.46 
 
 
293 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
325 aa  172  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 
285 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
286 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 
289 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 
284 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 
285 aa  149  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
306 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
288 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 
282 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  36.39 
 
 
300 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
293 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
288 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
300 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
283 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
281 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.33 
 
 
282 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 
282 aa  126  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
294 aa  126  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  33.1 
 
 
295 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
282 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
282 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 
283 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  29.62 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
282 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
287 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
283 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1151  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.29 
 
 
203 aa  115  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.637833  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1637  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.65 
 
 
202 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  32 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
333 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  28.27 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  28.27 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 
285 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0216  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.85 
 
 
204 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  28.01 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  29.14 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
286 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>