More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2634 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
333 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  56.42 
 
 
353 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  57.93 
 
 
337 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  56.12 
 
 
338 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  50.3 
 
 
338 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  38.48 
 
 
386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.24 
 
 
231 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 
325 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.23 
 
 
231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.23 
 
 
231 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.87 
 
 
231 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
325 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
325 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.3 
 
 
231 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 
325 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 
325 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
325 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 
325 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.23 
 
 
230 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 
325 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.38 
 
 
231 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.11 
 
 
230 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
325 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
324 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 
330 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
288 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
325 aa  159  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
288 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
288 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
306 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.74 
 
 
230 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
288 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.55 
 
 
232 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  38.72 
 
 
325 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
327 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 
284 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43 
 
 
239 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.67 
 
 
237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  33.86 
 
 
300 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.15 
 
 
236 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
285 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.15 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40 
 
 
225 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
286 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
292 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
296 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
286 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
285 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
290 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.27 
 
 
282 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
299 aa  122  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  28 
 
 
325 aa  119  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
324 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
305 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  33.86 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
295 aa  117  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
331 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
299 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
299 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
299 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
299 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  29.28 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
299 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
290 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
310 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
299 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
299 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
299 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>