More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4293 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 330 aa  643    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  84.42 
 
 		 325 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  85.05 
 
 		 325 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  84.74 
 
 		 325 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  81.31 
 
 		 327 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  81.82 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  64.29 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  62.73 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  59.56 
 
 		 325 aa  363  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  58.88 
 
 		 325 aa  358  7e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  61.68 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  57.32 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  57.63 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  57.5 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  56.39 
 
 		 325 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  58.44 
 
 		 325 aa  342  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.6 
 
 		 231 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.02 
 
 		 231 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.8 
 
 		 230 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  58.97 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.77 
 
 		 230 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.4 
 
 		 231 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.02 
 
 		 231 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.87 
 
 		 231 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.55 
 
 		 231 aa  235  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50 
 
 		 230 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.09 
 
 		 237 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.84 
 
 		 232 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.45 
 
 		 239 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50 
 
 		 236 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50 
 
 		 236 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.64 
 
 		 225 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  36.58 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 		 337 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  27.49 
 
 		 338 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  30.75 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  37.98 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 285 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 		 293 aa  89.4  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 		 286 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.77 
 
 		 282 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  36.29 
 
 		 554 aa  86.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.58 
 
 		 219 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5474  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.22 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1637  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.52 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2919  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.47 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2174  ATP phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0363  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.85 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  26.77 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0391  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.85 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0393  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.85 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  31.27 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>