More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4747 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 324 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  65.94 
 
 		 325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  65.94 
 
 		 325 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  65.33 
 
 		 325 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  65.63 
 
 		 325 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 		 325 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  65.33 
 
 		 325 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  60.68 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  60.56 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  61.06 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  58.82 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  61.68 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  56.97 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  64.84 
 
 		 344 aa  335  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.21 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  46.97 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.05 
 
 		 231 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.4 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.56 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.07 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.4 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  54.63 
 
 		 230 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.61 
 
 		 231 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.03 
 
 		 237 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.2 
 
 		 239 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.56 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.3 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.3 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.69 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.93 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.11 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  29.5 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  30.79 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 282 aa  99  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  28.3 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  26.33 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  28.25 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  26.02 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  25.8 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  26.02 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 		 283 aa  90.9  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 554 aa  83.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  27.18 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.31 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  31.22 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0632  ATP phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  25.87 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2174  ATP phosphoribosyltransferase  29.74 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1964  ATP phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.5 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  29.47 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  33.51 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1491  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.38 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0152301  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  30.81 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1637  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.88 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2919  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.48 
 
 		 223 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1151  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.61 
 
 		 203 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.637833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3101  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.81 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5474  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2777  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.67 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0752038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.03 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>