More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3101 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3101  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0383  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  95.75 
 
 
212 aa  417  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4058  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  90.09 
 
 
234 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3801  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  83.96 
 
 
212 aa  377  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3706  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  83.96 
 
 
212 aa  377  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3043  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  84.76 
 
 
212 aa  362  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00016685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0819  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  79.52 
 
 
213 aa  343  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0887901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.76 
 
 
219 aa  339  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.65 
 
 
213 aa  232  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3040  ATP phosphoribosyltransferase  58.22 
 
 
215 aa  229  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2649  ATP phosphoribosyltransferase  58.22 
 
 
215 aa  229  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2777  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 
221 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0752038  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0381  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  54.37 
 
 
214 aa  223  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2881  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  53.33 
 
 
213 aa  222  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2356  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.52 
 
 
222 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000440945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1491  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.87 
 
 
223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0152301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.63 
 
 
225 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2001  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.71 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.911553  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3249  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.24 
 
 
224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.845388  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2786  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.17 
 
 
215 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3112  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.72 
 
 
224 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2883  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.05 
 
 
229 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3230  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.05 
 
 
229 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.2 
 
 
212 aa  208  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0883  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.67 
 
 
211 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2702  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.7 
 
 
214 aa  208  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.805897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0351  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.29 
 
 
217 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0342  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.29 
 
 
217 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3561  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.24 
 
 
232 aa  207  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.399643  hitchhiker  0.0000178128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0397  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.24 
 
 
232 aa  207  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5526  ATP phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
216 aa  207  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2683  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.29 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0424  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.29 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2994  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.29 
 
 
218 aa  207  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2760  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.72 
 
 
232 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2715  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
218 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4134  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.2 
 
 
211 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333994  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3694  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
218 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0870  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.72 
 
 
211 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144318  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3667  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
218 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0380  ATP phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
216 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2766  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
218 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3725  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
218 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3238  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
218 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.297185  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1787  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
218 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4439  ATP phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
211 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309969  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0327  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
217 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3388  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.24 
 
 
214 aa  205  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3886  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.04 
 
 
211 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1769  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.56 
 
 
217 aa  205  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1964  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.2 
 
 
213 aa  204  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.952274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0550  ATP phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
210 aa  204  6e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.775439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12920  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.67 
 
 
211 aa  204  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0972  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.76 
 
 
211 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1004  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.24 
 
 
211 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5474  ATP phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
231 aa  203  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57800  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.24 
 
 
211 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5021  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.72 
 
 
211 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0965  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.24 
 
 
211 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0907722  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1525  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.56 
 
 
211 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4250  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.28 
 
 
211 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1327  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.04 
 
 
211 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1458  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.04 
 
 
211 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0403  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
217 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3522  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.82 
 
 
217 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2980  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
206 aa  201  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1586  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.74 
 
 
214 aa  201  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0087708 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1316  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.08 
 
 
211 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1290  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.08 
 
 
211 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1890  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  53.03 
 
 
216 aa  201  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1425  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.08 
 
 
211 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1289  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.6 
 
 
211 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0726  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.36 
 
 
216 aa  201  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1496  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.6 
 
 
211 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1128  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.06 
 
 
210 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0759  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.36 
 
 
216 aa  201  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.0720902 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1564  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.08 
 
 
211 aa  201  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2216  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.2 
 
 
215 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2779  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.31 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0743  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.8 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0106  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.940502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3157  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.49 
 
 
207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2772  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.15 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.3 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0830  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.24 
 
 
214 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81865  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0105  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
208 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.951142 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3169  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.33 
 
 
213 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.992419  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1964  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2407  ATP phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
214 aa  194  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.155904  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0899  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.76 
 
 
214 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0502  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.34 
 
 
223 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1023  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.27 
 
 
222 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
213 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0247  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.28 
 
 
214 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0766  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.33 
 
 
216 aa  192  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0803  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.09 
 
 
233 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2174  ATP phosphoribosyltransferase  48 
 
 
205 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0393  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.6 
 
 
221 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2213  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.6 
 
 
216 aa  191  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0695  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.6 
 
 
217 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>