More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3188 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 325 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  91.98 
 
 		 325 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  86.07 
 
 		 325 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  86.73 
 
 		 325 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  85.49 
 
 		 325 aa  570  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  84.57 
 
 		 325 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  84.88 
 
 		 325 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  65.63 
 
 		 324 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  61.85 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  60.62 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  60.19 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  58.88 
 
 		 330 aa  358  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  59.19 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  58.39 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  58.39 
 
 		 325 aa  352  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  58.39 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.9 
 
 		 231 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.53 
 
 		 230 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.65 
 
 		 231 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.22 
 
 		 231 aa  238  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.76 
 
 		 230 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.6 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.35 
 
 		 231 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.17 
 
 		 231 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  55 
 
 		 331 aa  225  8e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.32 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.55 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.3 
 
 		 237 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.77 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.77 
 
 		 236 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.58 
 
 		 232 aa  193  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.44 
 
 		 225 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  37.01 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  30.95 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  29.94 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  27.18 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  30.35 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 284 aa  96.3  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  25.39 
 
 		 288 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 286 aa  95.9  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  25.08 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  24.45 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 285 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0632  ATP phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 		 204 aa  85.9  9e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  28.69 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  27.83 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  34.26 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  30.81 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2919  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.55 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0502  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.67 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5474  ATP phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.96 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.96 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2174  ATP phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 205 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4058  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.14 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3706  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3801  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0391  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.49 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>