More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4679 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
331 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  51.24 
 
 
330 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
325 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 
325 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 
325 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  45.2 
 
 
325 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  45.2 
 
 
325 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  46.69 
 
 
325 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
325 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
325 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  46.44 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  47.72 
 
 
325 aa  259  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
325 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  45.2 
 
 
325 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  48.14 
 
 
327 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
324 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  56.2 
 
 
344 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.68 
 
 
230 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.23 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.69 
 
 
231 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.48 
 
 
231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.77 
 
 
231 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.08 
 
 
230 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.22 
 
 
230 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
231 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.98 
 
 
237 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50 
 
 
231 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.05 
 
 
232 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
236 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
236 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.41 
 
 
239 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.88 
 
 
225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  35.42 
 
 
338 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
333 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  36.5 
 
 
353 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 
337 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.7 
 
 
338 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  33 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  33.86 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  33.47 
 
 
300 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 
286 aa  92.4  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 
288 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
284 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
306 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
286 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
304 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
282 aa  85.9  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  30.62 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  28.15 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  32.86 
 
 
295 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.98 
 
 
212 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2216  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.33 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  27.95 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.64 
 
 
213 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
299 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
299 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
299 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
299 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 
299 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
299 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
299 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  27.51 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1023  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.04 
 
 
222 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1903  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.15 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000125958  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.7 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2193  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.15 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000274896  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.51 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.46 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4216  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.19 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>