More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0600 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 325 aa  649    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  60.62 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  60.62 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  60.31 
 
 		 325 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  58.82 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  58.46 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  60.19 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  57.85 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  59.08 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  58.9 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  58.44 
 
 		 330 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  58.59 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  56.97 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  59.32 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  63.91 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.15 
 
 		 230 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.33 
 
 		 231 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.13 
 
 		 231 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  59.51 
 
 		 231 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  59.9 
 
 		 231 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.94 
 
 		 230 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  59.9 
 
 		 231 aa  235  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  59.42 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.35 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.88 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  53.33 
 
 		 230 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  53.95 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  53.95 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.55 
 
 		 232 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.76 
 
 		 225 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 		 353 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  31.07 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  32.34 
 
 		 386 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  33.86 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.24 
 
 		 282 aa  89.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1128  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.63 
 
 		 210 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 		 294 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  30.15 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1016  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.63 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 554 aa  82.8  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1458  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  28.72 
 
 		 211 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4216  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.64 
 
 		 220 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3886  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  28.72 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1327  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.1 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1964  ATP phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1525  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.1 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.62 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  28.4 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.48 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.82 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.73 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>