More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3180 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 353 aa  708    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  93.2 
 
 		 338 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  56.42 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  46.76 
 
 		 338 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  37.61 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 		 325 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  37.46 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.53 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.64 
 
 		 231 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.75 
 
 		 231 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.75 
 
 		 231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 		 324 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.86 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 		 344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  41.27 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.54 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.19 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.18 
 
 		 231 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.39 
 
 		 237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.33 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.74 
 
 		 236 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.93 
 
 		 230 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.74 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.57 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  41.81 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  38.65 
 
 		 225 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 288 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  34.88 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  32.27 
 
 		 287 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  26.81 
 
 		 306 aa  113  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  31.27 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  34.77 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.15 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  31.89 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 299 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  31.89 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  31.89 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  31.89 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  25.95 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 		 283 aa  106  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  30.12 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 		 554 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  28.94 
 
 		 284 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 286 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 		 283 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  26.81 
 
 		 286 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 		 281 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 		 282 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 		 281 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  32.6 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.78 
 
 		 228 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  36.41 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>