More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1774 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
325 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  73.21 
 
 
325 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  63.27 
 
 
325 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  62.73 
 
 
330 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  62.46 
 
 
325 aa  384  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  62.46 
 
 
325 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 
325 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  60.62 
 
 
325 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  59.69 
 
 
325 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
325 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  58.62 
 
 
325 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  61.16 
 
 
327 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  58.75 
 
 
325 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  58.82 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  57.81 
 
 
325 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  68.63 
 
 
344 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
325 aa  325  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  53.36 
 
 
230 aa  232  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  54.5 
 
 
231 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  54.98 
 
 
231 aa  228  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.04 
 
 
231 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.56 
 
 
231 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  54.9 
 
 
231 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.88 
 
 
231 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  53.81 
 
 
230 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  55 
 
 
331 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.93 
 
 
237 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.43 
 
 
230 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.73 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.07 
 
 
236 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.07 
 
 
236 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 
338 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.35 
 
 
232 aa  182  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  37.46 
 
 
353 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.41 
 
 
225 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  35.01 
 
 
337 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  38.72 
 
 
333 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.87 
 
 
338 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.46 
 
 
288 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  32.24 
 
 
386 aa  116  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
306 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  37.44 
 
 
282 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
286 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
288 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
288 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
282 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 
285 aa  89  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
293 aa  86.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.84 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.52 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5474  ATP phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.36 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 
554 aa  79.7  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.97 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1766  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.68 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0327  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.69 
 
 
217 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0351  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.69 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0342  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.69 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  28.96 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3725  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.92 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2715  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.92 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3667  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.92 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3694  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.92 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1787  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.92 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2766  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.92 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2994  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.03 
 
 
218 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2683  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.4 
 
 
217 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0424  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.4 
 
 
217 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1708  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.2 
 
 
208 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0632  ATP phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
204 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3238  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.92 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.297185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.68 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3043  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.69 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00016685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4058  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2702  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.61 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.805897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3388  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.75 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.55 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0383  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.65 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2694  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.65 
 
 
237 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.351192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3706  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.66 
 
 
212 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3801  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.66 
 
 
212 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0819  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.44 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0887901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
291 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0393  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.65 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1586  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.33 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0087708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>