More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1586 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1586  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
214 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0087708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0830  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  85.65 
 
 
214 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81865  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  79.52 
 
 
213 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1023  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  82.35 
 
 
222 aa  340  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0726  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  80.86 
 
 
216 aa  340  9e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0759  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  80.86 
 
 
216 aa  340  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.0720902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  77.73 
 
 
212 aa  338  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3522  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  77.56 
 
 
217 aa  331  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3561  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  77.56 
 
 
232 aa  331  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.399643  hitchhiker  0.0000178128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0397  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  77.56 
 
 
232 aa  331  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0403  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  77.56 
 
 
217 aa  331  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2760  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  77.56 
 
 
232 aa  328  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0247  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  73.58 
 
 
214 aa  328  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0538272  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0351  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  76.1 
 
 
217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0342  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  76.1 
 
 
217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0327  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  76.1 
 
 
217 aa  324  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5526  ATP phosphoribosyltransferase  76.56 
 
 
216 aa  324  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2683  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  76.1 
 
 
217 aa  324  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0424  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  76.1 
 
 
217 aa  324  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2994  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  76.1 
 
 
218 aa  321  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0803  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  75.71 
 
 
233 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1787  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.18 
 
 
218 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3725  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.18 
 
 
218 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2715  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.18 
 
 
218 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3694  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.18 
 
 
218 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3667  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.18 
 
 
218 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2766  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.18 
 
 
218 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3238  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.18 
 
 
218 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.297185  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0695  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  75.36 
 
 
217 aa  321  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3249  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.88 
 
 
224 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.845388  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3388  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  74.16 
 
 
214 aa  318  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4452  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  75.98 
 
 
252 aa  317  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.121483  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0820  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  70.81 
 
 
227 aa  317  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0899  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  72.73 
 
 
214 aa  315  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3112  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  73.46 
 
 
224 aa  314  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2883  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  73.81 
 
 
229 aa  314  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3230  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  73.81 
 
 
229 aa  314  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1890  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  73 
 
 
216 aa  298  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0106  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  67.98 
 
 
208 aa  288  6e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.940502  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0105  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  67.82 
 
 
208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.951142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0743  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  59.81 
 
 
216 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0883  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.81 
 
 
211 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2113  ATP phosphoribosyltransferase  62.26 
 
 
214 aa  250  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2216  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.96 
 
 
215 aa  249  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4439  ATP phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 
211 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4134  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
211 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333994  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0870  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.34 
 
 
211 aa  247  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144318  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5021  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
211 aa  247  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0965  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.34 
 
 
211 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0907722  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0380  ATP phosphoribosyltransferase  58.85 
 
 
216 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57800  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.28 
 
 
211 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2702  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.08 
 
 
214 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.805897  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1004  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.87 
 
 
211 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12920  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.87 
 
 
211 aa  244  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0972  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.87 
 
 
211 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4250  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.87 
 
 
211 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1964  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  59.15 
 
 
213 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.952274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2779  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.42 
 
 
213 aa  241  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2213  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.66 
 
 
216 aa  234  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3169  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.19 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.992419  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2649  ATP phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
215 aa  232  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3040  ATP phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
215 aa  232  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1903  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  53.08 
 
 
231 aa  231  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000125958  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2193  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.61 
 
 
231 aa  231  7.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000274896  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0766  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.45 
 
 
216 aa  229  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0502  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.38 
 
 
223 aa  227  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0988  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.15 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0819  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.52 
 
 
213 aa  204  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0887901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3101  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.76 
 
 
212 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.95 
 
 
219 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0383  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.52 
 
 
212 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2407  ATP phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
214 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.155904  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3043  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.72 
 
 
212 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00016685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4058  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.33 
 
 
234 aa  198  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3801  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.19 
 
 
212 aa  197  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3706  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.19 
 
 
212 aa  197  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2777  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.87 
 
 
221 aa  184  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0752038  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2772  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.76 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2919  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.66 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1128  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.04 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2694  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.73 
 
 
237 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.351192  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0782  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.25 
 
 
220 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2881  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.58 
 
 
213 aa  174  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0550  ATP phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
210 aa  172  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.775439  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2141  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.36 
 
 
235 aa  171  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341596  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1525  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.76 
 
 
211 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1564  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.63 
 
 
211 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2786  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.66 
 
 
215 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2001  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.51 
 
 
211 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.911553  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3886  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.15 
 
 
211 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1327  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.11 
 
 
211 aa  168  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1316  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.15 
 
 
211 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1290  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.15 
 
 
211 aa  167  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1425  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.15 
 
 
211 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1496  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.67 
 
 
211 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1289  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.67 
 
 
211 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0381  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.12 
 
 
214 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2027  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.33 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0111404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1458  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.67 
 
 
211 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3157  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.86 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>