More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0189 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  99.13 
 
 
231 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  91.27 
 
 
231 aa  424  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  72.49 
 
 
230 aa  334  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  68.83 
 
 
231 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  69.7 
 
 
231 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  68.4 
 
 
231 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  72.51 
 
 
230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  56.84 
 
 
325 aa  246  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  56.47 
 
 
325 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 
325 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
325 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
325 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  56.65 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  58.65 
 
 
327 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 
330 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 
325 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  58.65 
 
 
344 aa  234  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 
325 aa  232  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  55.76 
 
 
325 aa  228  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  56.04 
 
 
325 aa  228  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 
325 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  56.19 
 
 
325 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
324 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.17 
 
 
237 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.48 
 
 
230 aa  201  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
232 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.88 
 
 
236 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.43 
 
 
236 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.52 
 
 
239 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.39 
 
 
225 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  46.23 
 
 
338 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  45.75 
 
 
353 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 
331 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  43 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  44.13 
 
 
337 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  33.91 
 
 
386 aa  128  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.07 
 
 
284 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
289 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
288 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
288 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
306 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
288 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
300 aa  98.6  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.03 
 
 
300 aa  98.6  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 
286 aa  98.2  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 
284 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  34.88 
 
 
295 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0550  ATP phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
210 aa  95.1  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.775439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 
294 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
286 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3388  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.82 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  33.03 
 
 
293 aa  92.8  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.6 
 
 
212 aa  92  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
285 aa  92  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
292 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
285 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  34.15 
 
 
282 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2356  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.76 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000440945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
285 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1586  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.87 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0087708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0820  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.42 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.57 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 
282 aa  88.6  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1491  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.48 
 
 
223 aa  88.6  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0152301  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0695  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.84 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4452  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.92 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.121483  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.05 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  34.42 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0351  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.49 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0342  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.49 
 
 
217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0899  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.8 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1023  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.79 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.13 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3230  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.48 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0803  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.08 
 
 
233 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2883  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.48 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0511367 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0327  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.49 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2683  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.49 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1205  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.29 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0424  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.49 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0830  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.75 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81865  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
296 aa  85.5  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3112  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.5 
 
 
224 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2786  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.52 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  28.88 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3249  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.99 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.845388  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1637  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.8 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3801  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.82 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02190  ATP phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0242064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3706  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.82 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>