More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28808 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  100 
 
 
386 aa  791    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  38.48 
 
 
333 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.8 
 
 
338 aa  239  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 
353 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
338 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 
337 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
325 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 
325 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
325 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 
325 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 
325 aa  136  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 
325 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
285 aa  129  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  29.59 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.07 
 
 
231 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  30.75 
 
 
330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.48 
 
 
284 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  29.59 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.91 
 
 
231 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.76 
 
 
230 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.48 
 
 
231 aa  126  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 
325 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
324 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
286 aa  122  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.81 
 
 
231 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30.79 
 
 
289 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.24 
 
 
230 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.81 
 
 
231 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.18 
 
 
231 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
292 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
299 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
288 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
299 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
299 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  26.87 
 
 
299 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
288 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
325 aa  116  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  26.87 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  27.3 
 
 
299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  27.3 
 
 
299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  27.3 
 
 
299 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
288 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  27 
 
 
299 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  27 
 
 
299 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  27 
 
 
299 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  27 
 
 
299 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  27 
 
 
299 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  27 
 
 
299 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  27.24 
 
 
293 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  28.34 
 
 
293 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  27 
 
 
299 aa  112  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  29.97 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  28.05 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 
299 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 
299 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 
299 aa  109  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 
283 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
299 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  27.24 
 
 
293 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  27.36 
 
 
288 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 
299 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 
300 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
344 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
299 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  25.6 
 
 
299 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
327 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
298 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  27.76 
 
 
298 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  25.6 
 
 
298 aa  106  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
286 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 
299 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  38.5 
 
 
228 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
305 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  25.75 
 
 
299 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  24.93 
 
 
299 aa  104  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.48 
 
 
237 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  27.55 
 
 
298 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
331 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 
294 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30 
 
 
230 aa  102  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  28 
 
 
307 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 
287 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
284 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
286 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
282 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  25.55 
 
 
299 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.02 
 
 
294 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  31 
 
 
303 aa  99.8  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  25.24 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4452  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.38 
 
 
252 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.121483  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  25.61 
 
 
299 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  25.38 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  25.47 
 
 
297 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>